En favorisant l’intégration des ses diplômés dans des Master recherche (comme par exemple, le Master Sciences et Techniques des Activités Physiques et Sportives (STAPS), Spécialité Sciences du Mouvement Humain (SMH) à l’Université Aix-Marseille, le COP Aix-Marseille travaille quotidiennement pour renforcer ses liens avec les instances universitaires et dispose de plusieurs partenariats avec de grands établissements hospitaliers.